忍者神龟：变种时代

纽约市不断发生神秘犯罪事件，记者爱普莉尔·奥尼尔在调查中发现了四只拥有人类智慧和忍者技能的神龟——莱昂纳多、拉斐尔、米开朗基罗和多纳泰罗。原来，它们因接触外星变异物质而从普通乌龟变成了半人半龟的生物，由一只变异老鼠斯普林特训练成忍者。与此同时，邪恶的施莱德和他背后的脚帮组织妄图统治城市。神龟们与爱普莉尔、警察维恩·芬威克联手对抗施莱德。在激烈战斗中，神龟们充分发挥各自技能，历经艰难最终打败施莱德，守护了纽约的和平，也逐渐被人们所接纳。